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Si l'animation n'apparaît pas ci-contre à droite, il vous faut télécharger et installer le plug-in CHIME nécessaire pour visionner les infographies moléculaires présentées sur cette page.
Mise à jour :
Novembre 2007
Chime fonctionne sous Windows 98, 2000, XP ... avec des navigateurs acceptant JavaScript comme Netscape Communicator (à partir de la version 3.04 ) ou Microsoft Internet Explorer (à partir de la version 4.0). Il s'installe automatiquement avec ces navigateurs.
Avec Mozilla ou FireFox
L’installeur de Chime cherche par défaut le navigateur netscape.exe et ne le trouve pas. Dans ce cas, installez Chime pour Internet Explorer puis recherchez dans le répertoire /plugins d’Internet Explorer (C > program Files > Internet Explorer > PLUGINS) les 5 fichiers contenant le mot « chime » et copiez les dans le répertoire /plugins du navigateur Mozilla ou FireFox.
Introduction

Les logiciels d'infographie moléculaire appartenant à la famille issue de Rasmol comme Chime, Protein Explorer, Rastop, Molusc, etc. permettent d'afficher et de manipuler des modèles de molécules reconstruits à partir des fichiers .pdb (Protein Data Bank) de coordonnées atomiques contenus dans les banques de données internationales, telle la Protein Data Bank
Les commandes de ces logiciels permettent d'affecter diverses représentations conventionnelles (boules, rubans, squelette carboné, surfaces de Van der Waals, couleurs, etc.) à des atomes choisis par l'utilisateur, d'examiner les modèles sous tous les angles de vue, de réaliser des mesures (angles, distances, etc.), de comparer des modèles, de réaliser des scripts, d'exporter des images... 
Chime permet de réaliser ces opérations en ligne dans une page web à partir de fichiers .pdb chargés sur le serveur. 
Après installation de Chime sur votre ordinateur, les liens de la table des matières ci-dessous vous conduisent à des modèles moléculaires tridimensionnels manipulables en ligne. 
Chime peut être téléchargé à partir du site BIO-GEO de l'INRP et il doit être installé ensuite sur votre ordinateur.

Dans ce site, trois types d'animations sont disponibles selon les molécules : 

  • les modèles moléculaires présentés dans une fenêtre Chime sont repérés par l'icône ;
  • certaines macromolécules sont présentées dans une visionneuse 3D dont les commandes sont accessibles par des boutons et sont repérées par l'icône ;
  • d'autres modèles sont présentés dans une animation commandée par un script et sont repérés par l'icône .
Ne pas démarrer un script avant la fin du téléchargement du fichier pdb.
Soyez patient, le téléchargement de certaines macromolécules peut être un peu long avec un modem 54K.
D'autres molécules continuent à être ajoutées à la liste.

Sommaire


.Voir ci-dessous la table des matières détaillée :

Table des matières détaillée

  • Petites molécules

    • Glucides
    • Lipides
    • Pigments végétaux
    • Vitamines


  • Macromolécules glucidiques

....
  •  Protéines

    • Globines
    • Système immunitaire

    • Cycle cellulaire

  • Acides nucléiques


  • Virus
......

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